MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bifidobacterium animalis subsp. animalis ATCC 25527 chromosome

Total Repeats: 37736

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017834	CG	4	8	223	230	0 %	0 %	50 %	50 %	386866199
2	NC_017834	GGCT	2	8	236	243	0 %	25 %	50 %	25 %	386866199
3	NC_017834	CAC	2	6	274	279	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386866199
4	NC_017834	GC	3	6	351	356	0 %	0 %	50 %	50 %	386866199
5	NC_017834	GCC	2	6	406	411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386866199
6	NC_017834	GGA	2	6	445	450	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386866199
7	NC_017834	GCC	2	6	482	487	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386866199
8	NC_017834	C	6	6	520	525	0 %	0 %	0 %	100 %	386866199
9	NC_017834	CGG	2	6	561	566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386866199
10	NC_017834	GCC	2	6	627	632	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386866199
11	NC_017834	ACG	2	6	678	683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386866199
12	NC_017834	CCG	2	6	750	755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386866199
13	NC_017834	CGC	2	6	768	773	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386866199
14	NC_017834	GTTC	2	8	789	796	0 %	50 %	25 %	25 %	386866199
15	NC_017834	CGG	2	6	958	963	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386866199
16	NC_017834	TCT	2	6	985	990	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386866199
17	NC_017834	CG	3	6	1035	1040	0 %	0 %	50 %	50 %	386866199
18	NC_017834	CGAG	2	8	1053	1060	25 %	0 %	50 %	25 %	386866199
19	NC_017834	ACGA	2	8	1067	1074	50 %	0 %	25 %	25 %	386866199
20	NC_017834	TGC	2	6	1161	1166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386866199
21	NC_017834	CGA	2	6	1171	1176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386866199
22	NC_017834	CGG	2	6	1189	1194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386866199
23	NC_017834	TTC	2	6	1217	1222	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386866199
24	NC_017834	GCC	2	6	1279	1284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386866199
25	NC_017834	GGA	2	6	1294	1299	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386866199
26	NC_017834	GCC	2	6	1354	1359	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386866199
27	NC_017834	ACG	2	6	1425	1430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386866199
28	NC_017834	CAA	2	6	1459	1464	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386866199
29	NC_017834	GC	3	6	1482	1487	0 %	0 %	50 %	50 %	386866199
30	NC_017834	ACC	2	6	1518	1523	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386866199
31	NC_017834	CG	4	8	1533	1540	0 %	0 %	50 %	50 %	386866199
32	NC_017834	ACGC	2	8	1549	1556	25 %	0 %	25 %	50 %	386866199
33	NC_017834	CAC	2	6	1570	1575	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386866199
34	NC_017834	CAT	2	6	1600	1605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386866199
35	NC_017834	CG	4	8	1606	1613	0 %	0 %	50 %	50 %	386866199
36	NC_017834	CGA	2	6	1639	1644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386866199
37	NC_017834	CGG	2	6	1753	1758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386866199
38	NC_017834	ACCAC	2	10	1764	1773	40 %	0 %	0 %	60 %	386866199
39	NC_017834	CATG	2	8	1777	1784	25 %	25 %	25 %	25 %	386866199
40	NC_017834	AGC	2	6	1863	1868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386866199
41	NC_017834	TTCG	2	8	2509	2516	0 %	50 %	25 %	25 %	386866200
42	NC_017834	GAC	2	6	2533	2538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386866200
43	NC_017834	ACGC	2	8	2550	2557	25 %	0 %	25 %	50 %	386866200
44	NC_017834	GC	3	6	2642	2647	0 %	0 %	50 %	50 %	386866200
45	NC_017834	CGT	2	6	2683	2688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386866200
46	NC_017834	GCT	2	6	2701	2706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386866200
47	NC_017834	TGC	2	6	2724	2729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386866200
48	NC_017834	CCG	2	6	2730	2735	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386866200
49	NC_017834	GAC	2	6	2761	2766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386866200
50	NC_017834	CCGGC	2	10	2781	2790	0 %	0 %	40 %	60 %	386866200
51	NC_017834	CGA	2	6	3034	3039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386866200
52	NC_017834	GCG	2	6	3056	3061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386866200
53	NC_017834	CCG	2	6	3213	3218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386866200
54	NC_017834	GCC	2	6	3284	3289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386866200
55	NC_017834	TGG	2	6	3303	3308	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386866200
56	NC_017834	CAG	2	6	3347	3352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386866200
57	NC_017834	CTCACG	2	12	3353	3364	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	386866200
58	NC_017834	CGG	2	6	3367	3372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386866200
59	NC_017834	GAC	2	6	3505	3510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386866200
60	NC_017834	GCA	2	6	3538	3543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386866200
61	NC_017834	GAG	2	6	3557	3562	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386866200
62	NC_017834	TCG	2	6	3779	3784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386866201
63	NC_017834	TCG	2	6	3842	3847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386866201
64	NC_017834	CCA	2	6	3866	3871	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386866201
65	NC_017834	CG	3	6	3874	3879	0 %	0 %	50 %	50 %	386866201
66	NC_017834	ACA	2	6	3911	3916	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386866201
67	NC_017834	ACC	2	6	3940	3945	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386866201
68	NC_017834	CGG	2	6	3993	3998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386866201
69	NC_017834	CGTT	2	8	4096	4103	0 %	50 %	25 %	25 %	386866201
70	NC_017834	GCC	2	6	4114	4119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386866201
71	NC_017834	CG	3	6	4180	4185	0 %	0 %	50 %	50 %	386866201
72	NC_017834	GCT	2	6	4188	4193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386866201
73	NC_017834	AGG	2	6	4211	4216	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386866201
74	NC_017834	GAG	2	6	4231	4236	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386866201
75	NC_017834	GC	3	6	4237	4242	0 %	0 %	50 %	50 %	386866201
76	NC_017834	CGT	2	6	4409	4414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386866201
77	NC_017834	CGA	2	6	4416	4421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386866201
78	NC_017834	CGGG	2	8	4467	4474	0 %	0 %	75 %	25 %	386866201
79	NC_017834	GGC	2	6	4479	4484	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386866201
80	NC_017834	GAAT	2	8	4532	4539	50 %	25 %	25 %	0 %	386866201
81	NC_017834	GAC	2	6	4558	4563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386866201
82	NC_017834	TCG	2	6	4603	4608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386866201
83	NC_017834	CGCTGG	2	12	4625	4636	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	386866201
84	NC_017834	GTG	2	6	4693	4698	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386866201
85	NC_017834	CGA	2	6	4701	4706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386866201
86	NC_017834	ATC	2	6	4777	4782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386866201
87	NC_017834	GCG	2	6	4789	4794	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386866201
88	NC_017834	GAC	2	6	4819	4824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386866201
89	NC_017834	GCCCAT	2	12	4825	4836	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	386866201
90	NC_017834	GGC	2	6	4848	4853	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386866201
91	NC_017834	GGC	2	6	4873	4878	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386866201
92	NC_017834	GCCG	2	8	4908	4915	0 %	0 %	50 %	50 %	386866201
93	NC_017834	GCC	2	6	4939	4944	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386866201
94	NC_017834	CATG	2	8	5080	5087	25 %	25 %	25 %	25 %	386866201
95	NC_017834	CGA	2	6	5120	5125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386866202
96	NC_017834	GCCG	2	8	5135	5142	0 %	0 %	50 %	50 %	386866202
97	NC_017834	CGG	2	6	5187	5192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386866202
98	NC_017834	GAG	2	6	5202	5207	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386866202
99	NC_017834	CGA	2	6	5237	5242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386866202
100	NC_017834	GTT	2	6	5258	5263	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386866202
101	NC_017834	CGCA	2	8	5354	5361	25 %	0 %	25 %	50 %	386866202
102	NC_017834	TGGG	2	8	5367	5374	0 %	25 %	75 %	0 %	386866202
103	NC_017834	ACC	2	6	5424	5429	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386866202
104	NC_017834	GCAA	2	8	5545	5552	50 %	0 %	25 %	25 %	386866202
105	NC_017834	CAAC	2	8	5788	5795	50 %	0 %	0 %	50 %	386866203
106	NC_017834	CGATC	2	10	5832	5841	20 %	20 %	20 %	40 %	386866203
107	NC_017834	ACG	2	6	5876	5881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386866203
108	NC_017834	GAC	2	6	5890	5895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386866203
109	NC_017834	CAC	2	6	6007	6012	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386866203
110	NC_017834	TCG	2	6	6026	6031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386866203
111	NC_017834	CGA	2	6	6042	6047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386866203
112	NC_017834	CGA	2	6	6114	6119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386866203
113	NC_017834	CGA	2	6	6138	6143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386866203
114	NC_017834	CGG	2	6	6198	6203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386866203
115	NC_017834	GGC	2	6	6214	6219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386866203
116	NC_017834	CGG	2	6	6234	6239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386866203
117	NC_017834	GGT	2	6	6261	6266	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386866203
118	NC_017834	CG	3	6	6281	6286	0 %	0 %	50 %	50 %	386866203
119	NC_017834	CTA	2	6	6312	6317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386866203
120	NC_017834	CGA	3	9	6381	6389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386866203
121	NC_017834	GAC	2	6	6438	6443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386866203
122	NC_017834	GCA	2	6	6467	6472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386866203
123	NC_017834	CAG	2	6	6478	6483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386866203
124	NC_017834	CGA	2	6	6537	6542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386866203
125	NC_017834	GC	3	6	6544	6549	0 %	0 %	50 %	50 %	386866203
126	NC_017834	CGGCGA	2	12	6561	6572	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	386866203
127	NC_017834	GGA	2	6	6582	6587	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386866203
128	NC_017834	AC	3	6	6771	6776	50 %	0 %	0 %	50 %	386866203
129	NC_017834	CCA	2	6	6794	6799	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386866203
130	NC_017834	GGC	2	6	6805	6810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386866203
131	NC_017834	GAG	2	6	6817	6822	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386866203
132	NC_017834	CG	3	6	6829	6834	0 %	0 %	50 %	50 %	386866203
133	NC_017834	CAAAGA	2	12	6882	6893	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	386866203
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257	NC_017834	ACC	2	6	11664	11669	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386866206
258	NC_017834	CGA	2	6	11755	11760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386866206
259	NC_017834	TTCA	2	8	11816	11823	25 %	50 %	0 %	25 %	386866206
260	NC_017834	TGC	2	6	11850	11855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386866206
261	NC_017834	TGA	2	6	11862	11867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386866206
262	NC_017834	CGT	2	6	11869	11874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386866206
263	NC_017834	GTT	2	6	11875	11880	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386866206
264	NC_017834	GCTG	2	8	11912	11919	0 %	25 %	50 %	25 %	386866206
265	NC_017834	GCT	2	6	11952	11957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386866206
266	NC_017834	TCGACG	2	12	12024	12035	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386866206
267	NC_017834	ATGC	2	8	12072	12079	25 %	25 %	25 %	25 %	386866206
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269	NC_017834	CG	3	6	12300	12305	0 %	0 %	50 %	50 %	386866206
270	NC_017834	CTG	2	6	12347	12352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386866206
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281	NC_017834	CA	3	6	12893	12898	50 %	0 %	0 %	50 %	386866207
282	NC_017834	TGG	2	6	12939	12944	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386866207
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290	NC_017834	CAG	2	6	13408	13413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386866207
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294	NC_017834	GTT	2	6	13534	13539	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386866207
295	NC_017834	AGA	2	6	13905	13910	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386866208
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374	NC_017834	TC	3	6	18669	18674	0 %	50 %	0 %	50 %	386866211
375	NC_017834	GGA	2	6	18678	18683	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386866211
376	NC_017834	CTG	2	6	18697	18702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386866211
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379	NC_017834	CCG	2	6	18737	18742	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386866211
380	NC_017834	TGC	2	6	18750	18755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386866211
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382	NC_017834	CGC	2	6	19162	19167	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386866212
383	NC_017834	GCGT	2	8	19196	19203	0 %	25 %	50 %	25 %	386866212
384	NC_017834	CG	3	6	19918	19923	0 %	0 %	50 %	50 %	386866213
385	NC_017834	TGC	2	6	19963	19968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386866213
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499	NC_017834	GCG	2	6	27972	27977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386866220
500	NC_017834	GAT	2	6	27983	27988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386866220

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